Руководство по выбору реагентов для геномных исследований

Ассортимент реагентов для геномных исследований компании Beckman Coulter основывается на технологии обратимой твердофазной иммобилизации (SPRI), которая хорошо известна благодаря применению в нашем наборе Agencourt AMPure XP, в котором используются парамагнитные частицы для селективного связывания нуклеиновых кислот по типу и размеру. Благодаря технологии обратимой твердофазной иммобилизации наши химические реагенты реализуют высокоэффективные протоколы выделения и очистки в таких областях применения, как количественная ПЦР, цифровая капельная ПЦР, секвенирование по Сэнгеру, секвенирование нового поколения (NGS) и микроматричный анализ.

Чтобы узнать, поддерживают ли имеющиеся наборы ваши ручные или автоматизированные процессы пробоподготовки, ознакомьтесь с приведенной ниже таблицей для некоторых исходных материалов. Следует отметить, что список возможных исходных образцов не ограничивается образцами, указанными в таблице ниже.

 

ИСХОДНЫЙ МАТЕРИАЛ ВЫДЕЛЕНИЕ ОБЩЕЙ НК ВЫДЕЛЕНИЕ ДНК ВЫДЕЛЕНИЕ РНК ОЧИСТКА
ОБРАЗЦЫ МЛЕКОПИТАЮЩИХ
Буккальные мазки
 
 
Зафиксированные формалином и залитые парафином (FFPE) ткани
 
 
 
FTA карты/сухие пятна крови
 
Пробирки для сбора слюны OrageneTM
 
 
Пробирки для сбора слюны NorgenTM
 
Пробирки для сбора слюны OracollectTM Saliva Collection Tubes
 
Плазма
 
 
Сыворотка
 
Свежая или замороженная ткань
 
 
 
Цельная кровь
 
 
Образцы крови PAXGene
 
 
Молоко
 
Слюна, смывы ротовой полости
 
КУЛЬТУРЫ КЛЕТОК
Адгезионные и неадгезионные
 
 
Большое количество клеток (до 4 миллионов)
 
Первичные клетки (например мононуклеарные клетки периферической крови)
 
 
 
 
БАКТЕРИИ И ГРИБЫ
E. coli
 
 
 
Pseudomonas
 
 
Staphylococcus aureus
 
 
Klebsiella pneumoniae
 
Candida albicans
 
Neurospora intermedia
 
ПЛАЗМИДЫ
Искуственные бактериальные хромосомы (BACs), космиды, фосмиды
 
ВИРУСЫ
Вирус простого герпеса второго типа (HSV-2)
 
Вирус хронического гепатита C
 
 
 
ДРУГИЕ ОБРАЗЦЫ
Кровь птиц
 
Насекомые (например Drosophila)
 
 
Рыбы (например Данио полосатый)
 
 
Водные беспозвоночные
 
ОБРАЗЦЫ НУКЛЕИНОВЫХ КИСЛОТ
Синтез кДНК
 
Удаление терминирующих красителей
 
Транскрипция инвитро
 
 
Этапы сборки библиотек для NGS
 
 
 
Продукты ПЦР
 
 
Валидирован и полностью поддерживается
 
Продемонстрирована работа, получены данные и/или используется альтернативный протокол
 
Опробовано заказчиком, получены данные
Полезные ссылки