Оптимизация типа клеток

Для многих типов клеток подходят значения параметров по умолчанию, установленные в программном обеспечении.
Однако для некоторых клеточных линий требуется изменить параметры, чтобы оптимизировать анализ клеток

 

Параметры типа клеток

Типичный диапазон

Полный диапазон

Увеличение значения

Уменьшение значения

Когда необходимо изменить этот параметр

Предупреждения

Определяет, присутствие или отсутствие клеток

Минимальный диаметр

От 5 до 12 мкм

От 1 до 60 мкм

Выявляется меньше клеток

Выявляется больше клеток

Программа исключает небольшие клетки (обведены синим).

В анализе учитывается мусор.

Если значение слишком низкое, возможно включение мусора.

Если значение слишком высокое, исключаются клетки.

Максимальный диаметр

От 15 до 50 мкм

От 1 до 60 мкм

Выявляется больше клеток

Выявляется меньше клеток

Программа исключает крупные клетки (обведены синим).

Учитываются скопления клеток.

Если значение слишком низкое, возможно исключение клеток.

Учитываются скопления клеток.

Резкость изображения клеток

От 5 до 25

От 0 до 100

Выявляется меньше клеток

Выявляется больше клеток

Программа исключает «нечеткие" клетки.

Происходит захват нежелательного мусора.

Если установлено слишком высокое значение, клетки могут исключаться как мертвые, в результате чего процент жизнеспособных клеток будет определен неверно.

Определяет, жизнеспособны ли обнаруженные клетки

Яркость пятна жизнеспособной клетки

От 40 до 60 %

От 0 до 95 %

Больше клеток считаются мертвыми

Больше клеток считаются жизнеспособными

Жизнеспособные клетки считаются мертвыми.

Мертвые клетки считаются жизнеспособными.

Если значение слишком низкое, мертвые клетки могут начать считаться живыми.

Если значение слишком высокое, живые клетки могут начать считаться мертвыми.

Площадь пятна жизнеспособной клетки

От 3 до 12 %

От 0 до 95 %

Больше клеток считаются мертвыми

Больше клеток считаются жизнеспособными

Жизнеспособные клетки считаются мертвыми.

Мертвые клетки считаются жизнеспособными.

Если значение слишком низкое, мертвые клетки могут начать считаться живыми.

Если значение слишком высокое, живые клетки могут начать считаться мертвыми.

Определяет, присутствует ли клетка

Минимальная округлость

От 0 до 0,60

От 0 до 1,00

Будет исключаться больше мертвых клеток неправильной формы

Будет исключаться меньше мертвых клеток неправильной формы

Происходит захват нежелательного мусора неправильной формы

Если значение слишком низкое, возможен захват нежелательного мусора.

Если значение слишком высокое, прибор может начать исключать клетки.

Степень декластеризации

Отсутствует, от низкой до средней

Нет данных

Выявляется больше клеток

Выявляется меньше клеток

Клетки в кластерах пропускаются.

Одиночные клетки считаются как две и более клеток.

Если значение слишком низкое, возможен пропуск клеток в кластерах.

Если значение слишком высокое, возможна чрезмерная декластеризация, т. к. одиночные клетки будут считаться как две и более клеток.

 

Резкость изображения клеток

Резкость изображения клеток определяет границы клеток и варьируется от 0 до 100. Чем меньше значение, тем выше вероятность, что нечеткие объекты будут определяться как клетки. Увеличение резкости приведет к исключению менее четких клеток из подсчитанного количества.

Яркость пятна жизнеспособной клетки

Яркость пятна жизнеспособной клетки измеряется в центре клетки, чтобы определить, жизнеспособна ли клетка (аннотация зеленым или красным). При высоких значениях клетки с ярко-белыми центрами будут считаться жизнеспособными (уменьшение жизнеспособности). При низких значениях клетки с серыми центрами будут считаться жизнеспособными (увеличение жизнеспособности). Важно свериться с аннотацией, чтобы убедиться в правильности настройки яркости пятна жизнеспособной клетки.

Площадь пятна жизнеспособной клетки

Площадь пятна жизнеспособной клетки соответствует проценту площади белой части клетки, используемому для определения жизнеспособности клетки. При высоком значении некоторые жизнеспособные клетки могут быть подсчитаны как мертвые. Обычно нет необходимости настраивать этот параметр.

Минимальная округлость

Данный параметр используется, чтобы исключить мусор. Значение «1» соответствует идеальному кругу..

Степень декластеризации

Степень декластеризации определяет интенсивность декластеризации скоплений клеток. Если этот параметр отсутствует, декластеризация осуществляться не будет, что подходит для образцов с очень длинными клетками, не образующими скопления. Низкая степень рекомендуется для образцов со скоплениями из 2–3 клеток. Средняя степень подходит для образцов, содержащих скопления из более чем 3 клеток. Высокая степень подходит для дрожжевых клеток.